r – More columns than column names error in a text file
I am trying to read a text file in R studio but getting the error. Can anyone please help me to find out what is wrong with my coding?
Text file:
SampleID Temperature Genotype GxT
#q2:types Categorical Categorical Categorical
CSkab18C1 18 III-M III-M18
CSkab18C2 18 III-M III-M18
CSkab18C3 18 III-M III-M18
CSkab18C4 18 III-M III-M18
CSkab18C5 18 III-M III-M18
CSkab18C6 18 III-M III-M18
CSkab18C7 18 III-M III-M18
CSkab18C8 18 III-M III-M18
CSkab18C9 18 III-M III-M18
CSkab18C10 18 III-M III-M18
CSkab18C11 18 III-M III-M18
CSkab18C12 18 III-M III-M18
CSkab18C13 18 III-M III-M18
CSkab18C14 18 III-M III-M18
CSkab18C15 18 III-M III-M18
CSkab18C16 18 III-M III-M18
CSkab18C17 18 III-M III-M18
CSkab18C18 18 III-M III-M18
CSkab18C19 18 III-M III-M18
CSkab18C20 18 III-M III-M18
CSkab18C21 18 III-M III-M18
CSkab18C22 18 III-M III-M18
CSkab18C23 18 III-M III-M18
CSkab18C24 18 III-M III-M18
CSkab18C25 18 III-M III-M18
CSkab18C26 18 III-M III-M18
CSkab29C1 29 III-M III-M29
CSkab29C2 29 III-M III-M29
CSkab29C3 29 III-M III-M29
CSkab29C4 29 III-M III-M29
CSkab29C5 29 III-M III-M29
CSkab29C6 29 III-M III-M29
CSkab29C7 29 III-M III-M29
CSkab29C8 29 III-M III-M29
CSkab29C9 29 III-M III-M29
CSkab29C10 29 III-M III-M29
CSkab29C11 29 III-M III-M29
CSkab29C12 29 III-M III-M29
CSkab29C13 29 III-M III-M29
CSkab29C14 29 III-M III-M29
CSkab29C15 29 III-M III-M29
CSkab29C16 29 III-M III-M29
CSkab29C17 29 III-M III-M29
CSkab29C18 29 III-M III-M29
CSkab29C19 29 III-M III-M29
CSkab29C20 29 III-M III-M29
CSkab29C21 29 III-M III-M29
CSkab29C22 29 III-M III-M29
CSkab29C23 29 III-M III-M29
CSkab29C24 29 III-M III-M29
CSkab29C25 29 III-M III-M29
CSkab29C26 29 III-M III-M29
IsoCS18C1 18 Y-M Y-M18
IsoCS18C2 18 Y-M Y-M18
IsoCS18C3 18 Y-M Y-M18
IsoCS18C4 18 Y-M Y-M18
IsoCS18C5 18 Y-M Y-M18
IsoCS18C6 18 Y-M Y-M18
IsoCS18C7 18 Y-M Y-M18
IsoCS18C8 18 Y-M Y-M18
IsoCS18C9 18 Y-M Y-M18
IsoCS18C10 18 Y-M Y-M18
IsoCS18C11 18 Y-M Y-M18
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IsoCS18C18 18 Y-M Y-M18
IsoCS18C19 18 Y-M Y-M18
IsoCS18C20 18 Y-M Y-M18
IsoCS18C21 18 Y-M Y-M18
IsoCS18C22 18 Y-M Y-M18
IsoCS18C23 18 Y-M Y-M18
IsoCS18C24 18 Y-M Y-M18
IsoCS18C25 18 Y-M Y-M18
IsoCS18C26 18 Y-M Y-M18
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IsoCS29C23 29 Y-M Y-M29
IsoCS29C24 29 Y-M Y-M29
IsoCS29C25 29 Y-M Y-M29
IsoCS29C26 29 Y-M Y-M29
Error:
metadata_genevstemp <-read_q2metadata("sample_metadata_genevstemp.txt")
Error in read.table(file, header = F, col.names = coltitles, skip = 2, :
more columns than column names
Codes:
install.packages(qiime2R)
library (qiime2R)
metadata_genevstemp <-read_q2metadata("sample_metadata_genevstemp.txt")
I just wanted to read the file first for my further analysis but it is giving the error. But I didnt find any more columns than column names error in my text files.
Thank you
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